تولید گازهای اصلی محل دفن در پنج فاز متوالی اتفاق می افتد. این فازها عبارتند از:
1. فاز تطبیق اولیه یا فاز I (Initial adjustment phase):
در این فاز تجزیه بیولوژیکی تحت شرایط هوازی انجام می گیرد زیرا مقدار کمی هوا در محل دفن در بین زباله ها وجود دارد. منبع اصلی تامین، ارگانیسم های هوازی و بی هوازی برای تجزیه مواد زائد از مواد خاک پوششی است که برای پوشش روزانه و نهایی مواد زائد به کار می رود. از دیگر موارد تامین مواد غذایی برای ارگانسیمها، به لجن فاضلاب و شیرابه باز گردش شده می توان اشاره کرد.
2- فاز انتقالی یا فاز II (Transition phase) :
در این مرحله اکسیژن تمام شده و شرایط بیهوازی گسترش می یابد، در حین بی هوازی شدن محل دفن نیترات و سولفات که به عنوان پذیرنده الکترون در واکنش های بیوشیمیایی عمل می کنند، به ازت و سولفید هیدروژن تبدیل می شود. آغاز شرایط بی هوازی را می توان به وسیله اندازه گیری پتانسیل اکسیداسیون/ احیا تعیین کرد. شرایط مناسب برای احیاء نیترات و سولفات در پتانسیل 5- تا 100- میلی ولت اتفاق می افتد. وقتی که مقادیر پتانسیل اکسیداسیون/ احیاء حدود 150- تا 300- میلی ولت باشد تولید متان اتفاق می افتد اگر این پتانسیل کاهش یابد جمعیت میکروبی مسئول تولید متان خواهند بود. در این فاز PH شیرابه کاهش یافته و در صورت وجود اسیدهای آلی و CO2 باعث حالت اسیدی شیرابه می شود.
3- فاز اسیدی یا فاز III (Acid phase)
در این مرحله فعالیت میکروب تشدید شده منجر تولید مقادیر زیادی از اسیدهای آلی و مقادیر کمتری از گاز هیدروژن می گردد. واکنش در این فاز طی دو مرحله متوالی هیدرولیز و اسید زایی انجام می گیرد .در فرایند هیدرولیز مواد آلی با وزن مولکولی بالا به ترکیبات مناسب جهت استفاده سلولها تبدیل می گردد. میکروارگانیسم های فعال در این مرحله باکتریهای بی هوازی اجباری و اختیاری به نام های اسید وفور ( فرم دهنده اسید) یا استوژن (تولید کننده اسید) می باشند. در این مرحله گاز co2 و مقادیر کمی H2 و اسیدهای آلی به نام های استیک- اسید هیومیک و فولولیک تولید می شود. اگر در این مرحله شیرابه تولید شود به علت حضور اسیدهای آلی و co2 زیاد ، PH به 5 یا کمتر کاهش می یابد.
در فاز III، COD ، BOD و هدایت الکتریکی شیرابه به علت نامحلول بودن اسیدهای آلی در شیرابه به مقدار قابل توجهی افزایش خواهد یافت .همچنین در ایم مرحله به دلیل پایین بودن PH شیرابه مقدار زیادی فلزات سنگین و نوترنیت حل شده و مواد مغذی حذف می شود. پس در این مرحله باید شیرابه باز گردش شود تا مواد مغذی از دست نروند.
4- فاز تخمیر متان یا فاز IV (Methan fermentation)
در این مرحله میکروارگانیسم های بی هوازی به نام متائوژن ها، اسید استیک و گاز هیدروژن را به CH4 و co2 تبدیل می کنند. این میکروارگانیسم ها شدیدا بی هوازی اند و متان سازها نامیده می شوند،همچنین نسبت به تغییرات محیطی بالاخص نسبت به تغییرات PH حساس می باشند (PH مناسب7). در این مرحله اگرچه هم تشکیل اسید و هم تشکیل متان بطور همزمان صورت می پذیرد،بااین حال نرخ تشکیل اسید به طور قابل ملاحظه ای کاهش یافته است.
به دلیل اینکه اسیدها و گاز هیدروژن تولید شده توسط اسیدسازها در مرحله 4 به CH4 و co2تبدیل شده اند،مقدار PH درون محل دفن تا بیشتر از مقدار خنثی و محدوده 8/6-8 افزایش خواهند یافت.همچنین PH شیرابه در صورت تشکیل افزایش یافته و غلظت BOD5 و COD و قابلیت هدایت الکتریکی شیرابه کاهش خواهد یافت .با مقدار PH بالاتر،اجزای غیرآلی کمتری می توانند در محلول باقی بمانند. بنابراین غلظت فلزات سنگین موجود در شیرابه نیز کاهش خواهد یافت.
5- فاز تکمیلی یا فاز رسیدگی (Matunation phase):
در این مرحله مواد آلی قابل تجزیه بیولوژیکی به گاز CH4 و co2 تبدیل و به لحاظ کاهش ترکیبات آلی در زباله تولید این گازها به شدت کاهش پیدا می کند و به جای آنها گازهای N2 و O2 که حاصل تجزیه نهایی ترکیبات آلی است به وجود می آید ولی مقدار این گازها بسیار ناچیز است. در این مرحله میکروارگانیسم ها از نوع باکتریها از بین می روند چون مواد غذایی وجود نداشته اما قارچها و اکتینومیست ها فعال می شوند. شیرابه تولیدی در این مرحله اغلب دارای اسید هیومیک و اسید فولیک می باشد که این دو از جمله مواد آلی هستند که به سختی قابل تجزیه بیولوژیکی می باشند.